在ApcMin/+小鼠的辐射诱导小肠瘤中新发现的基因组突变模式

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 遗传学 是一个遗传学.
• 辐射生物学 辐射生物学

背景情况:

• 在ApcMin/+小鼠中的小肠瘤可以根据Adenomatous polyposis coli (Apc) 基因异常进行分类.
• 之前的研究将增加的辐射剂量与"未识别"瘤的更高发病率联系起来.
• 这些辐射诱导的未识别瘤的分子基础仍然不清楚.

研究的目的:

• 调查驱动辐射诱导未确定的小肠瘤的发展的分子机制.
• 确定Apc基因表达和改变在未确定的瘤形成中的作用.

主要方法:

• 在瘤和正常组织中分析Apc mRNA表达水平.
• 对Apc促进剂甲基化的研究.
• 用对第18号染色体进行数组比较基因组杂交 (aCGH) 的染色体分析.
• 下一代测序 (NGS) 用于APC基因突变分析.

主要成果:

• 与正常组织相比,Apc mRNA表达在未识别的瘤中明显较低.
• 没有检测到Apc促进体区域的高甲基化.
• aCGH分析显示,在APC地区没有拷贝数的变化.
• NGS在一个未识别的瘤中发现了Apc的小删除,并且在约30%的分析瘤中发现了Apc的无意义/移突变.

结论:

• 辐射诱导 未确定的瘤主要是由于通过未知的调节机制减少Apc表达的结果,独立于促进剂高甲基化.
• 这些瘤的子集可能来自Apc基因内的未定义点突变,包括无意义突变.