晚期,高度原发性瘤卵巢癌:一个多omics解剖和生物标志物预测过程
Yousof Saeedi Honar1, Saleh Javaher1, Marziye Soleimani2
1Department of Plant Biotechnology, Faculty of Life Sciences and Biotechnology, Shahid Beheshti University, Tehran, 1983963113, Iran.
Scientific reports
|October 12, 2023
概括
这项研究确定了高级原发性卵巢瘤中的关键基因,转录因子和miRNA. 这些发现为早期发现和治疗卵巢癌提供了潜在的新生物标志物.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 卵巢癌 (OC) 的发病率和死亡率在全球范围内不断上升.
- 在高度原发性瘤 (HGPTs) 中,先进的转移和模两可的生物标志物阻碍了早期检测.
研究的目的:
- 使用in silico分析识别高度原发性卵巢瘤 (HGPTs) 的新生物标志物.
- 阐明相关的基因,转录因子,激酶和信号通路,用于诊断和治疗方面的进展.
主要方法:
- 从53个HGPT和10个正常的卵巢样本获得的基因表达综合 (GEO) 微阵列数据的分析.
- 不同基因表达分析 (GEO2r),基因组丰富分析 (GSEA) 和蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络构建 (STRING,Cytoscape).
- 使用各种生物信息学工具识别枢纽基因,转录因子 (TF),激酶和微RNA (miRNA).
主要成果:
- 已经发现的十大核心基因包括KIAA0101,RAD51AP1,FAM83D,CEP55,PRC1,CKS2,CDCA5,NUSAP1,ECT2和TRIP13.
- 在HGPT中占主导地位的TF是SIN3A,VDR,TCF7L2,NFYA和FOXM1. CEP55,PRC1,CKS2,CDCA5和NUSAP1已经成为潜在的生物标志物.
- 确定的主要向miRNAs是hsa-miR-215-5p,hsa-miR-193b-3p,以及hsa-miR-192-5p.
结论:
- 与HGPT相关的基因,TFs和miRNAs代表了卵巢癌的有希望的生物标志物.
- 这些发现为开发卵巢癌的诊断和治疗策略提供了新的途径.
