转录组分析揭示了PdhR在Plesiomonas shigelloides中的影响

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 细菌病原体的产生
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 已知酸盐脱酶复合调节剂 (PdhR) 能控制细菌中的代谢途径.
• 它在 *Plesiomonas shigelloides* 病原发生中的特定功能在很大程度上仍未被描述.

研究的目的:

• 阐明PdhR在*Plesiomonas shigelloides*中的调节作用.
• 确定PdhR控制的基因和途径,包括与毒性和运动性相关的基因和途径.

主要方法:

• 在野生型和Δ*pdhR*突变菌株之间进行RNA测序比较 (RNA-Seq).
• 移动性测定和传输电子显微镜 (TEM) 来评估鞭毛功能.
• 定量实时聚合酶链反应 (qRT-PCR) 用于验证基因表达.

主要成果:

• 在P. shigelloides*转录组中,PdhR调节了大约7.38%的*P. shigelloides*转录组.
• 删除 *pdhR* 取消了鞭毛形成和运动性.
• PdhR积极调节III型分泌系统 (T3SS) 集群,增强P.shigelloides在Caco-2细胞中的毒性.
• PdhR直接抑制了 *pdhR-aceEF-lpd* 操作子, *metR* 和 *nuoA* 的表达.
• ArcA被确定为*pdhR*和*lpdA*的抑制剂.

结论:

• 在P. shigelloides*中,PdhR是运动性,鞭毛细胞合成和T3SS介导的毒性的主要调节者.
• 这项研究揭示了PdhR的新型监管目标,包括*metR*和*nuoA*.
• 这些发现为管理P. shigelloides病原性的复杂监管网络提供了洞察力.