在波兰武装部队中对SARS-CoV-2遗传变异的监测使用全基因组测序分析
Katarzyna Skuza1, Pawel Rutyna2, Lukasz Krzowski3
1Biological Threats Identification and Countermeasure Center, General Karol Kaczkowski Military Institute of Hygiene and Epidemiology, Lubelska 4, 24-100 Pulawy, Poland.
军事监测在部署在海外的波兰士兵中发现了SARS-CoV-2令人担忧的变体 (VOC). 任务前和后的查有效地防止了这些COVID-19变种的传播,保护了军方的健康.
科学领域:
- 军事医学 军事医学
- 传染病流行病学 传染病流行病学
- 基因组监测是指基因组的监测.
背景情况:
- 全球军事行动增加了传染病原体传播风险,包括SARS-CoV-2.
- 波兰武装部队在海外的持续参与需要一个有针对性的监视计划.
研究的目的:
- 在波兰军事人员中实施和评估SARS-CoV-2关注变种 (VOC) 的积极监测计划.
- 为了确定循环的SARS-CoV-2血统,并评估查措施的有效性.
主要方法:
- 从2021年11月到2022年5月,对1699名士兵进行RT-qPCR查.
- 在84个阳性样本上使用下一代测序 (NGS) 进行全基因组测序 (WGS).
- 鉴定SARS-CoV-2的血统,并将其分类为VOC.
主要成果:
- 确定了11个SARS-CoV-2血统,主要是BA.1.1 (57%),BA.1 (23%) 和BA.2 (6%).
- 所有检测到的谱系都被归类为VOC,并且已经在波兰传播.
- 发射前后的查和隔离成功防止了VOC的出口和进口.
结论:
- 积极的监测和严格的查措施是有效的控制SARS-CoV-2 VOC在军事环境中的传播.
- 积极的战略对于尽量减少COVID-19在全球行动期间对武装部队的影响至关重要.
- 军事卫生检查局的措施成功缓解了波兰武装部队内的COVID-19传播.
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