全癌性血蛋白质的绝对定量揭示了多发性髓瘤中独特的特征
David Kotol1,2, Jakob Woessmann1,2, Andreas Hober1,2
1Science For Life Laboratory, KTH Royal Institute of Technology, 114 28 Stockholm, Sweden.
Cancers
|October 14, 2023
概括
独立于数据采集的质谱仪能够在1800个血样本中精确量化蛋白质. 一个由七种蛋白质组成的面板显示出有希望的多发性骨髓瘤的高准确性诊断.
科学领域:
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 质谱测量质量谱测量
- 生物标志物发现发现
背景情况:
- 数据独立采集 (DIA) 质谱是一种强大的定量工具,在精密医学中具有应用.
- 稳定同位素重组蛋白质标准提高了蛋白质的识别和绝对量化准确性.
研究的目的:
- 使用向蛋白质组学,对来自15种癌症类型的1800个血样本组成的泛癌队列进行分析.
- 识别和验证蛋白质生物标记面板用于多发性骨髓瘤诊断.
主要方法:
- 使用DIA质谱仪使用全面的向蛋白质组学方法.
- 在1800个血样本的多重复合中对253种蛋白质进行绝对量化.
- 应用差异表达分析和机器学习用于生物标记物识别.
主要成果:
- 在1013个量化酸中实现了低的试验内变异性 (CV = 17.2%).
- 确定了用于多发性骨髓瘤诊断的七种蛋白质生物标志物小组.
- 开发了一种预测模型,用于多发性骨髓瘤检测,AUC为0.96.
结论:
- 开发的向蛋白质组学试验是强大的,可用于大规模的血分析.
- 确定了包括补充C1复合体,JCHAIN和CD5L在内的七种蛋白质小组,显示出早期多发性骨髓瘤诊断的重大潜力.
- 已知与免疫球蛋白相互作用的这些蛋白质提供了对多发性骨髓瘤病变的见解.
