从基因组驱动的发现含有谷氨胺的衍生物从Burkholderia gladioli
Hanna Chen1,2, Xianping Bai1, Tao Sun1
1Helmholtz International Lab for Anti-Infectives, Shandong University-Helmholtz Institute of Biotechnology, State Key Laboratory of Microbial Technology, Shandong University, Qingdao 266237, China.
Molecules (Basel, Switzerland)
|October 14, 2023
概括
基因组挖掘和基因工程激活了Burkholderia gladioli中的一个静态基因集群,产生了具有潜在抗炎功能的新型谷氨胺多基基.
科学领域:
- 自然产品的发现自然产品的发现
- 合成生物学 合成生物学
- 微生物基因组学 微生物基因组学
背景情况:
- 含有谷氨胺的多基基酸具有显著的抗瘤和抗微生物活性.
- 基因组采矿有助于发现这些有价值的化合物.
- 沉默的生物合成基因集群 (BGCs) 代表未开发的自然产品来源.
研究的目的:
- 为了激活一个安静的*trans*-AT PKS BGC 在 *Burkholderia gladioli* ATCC 10248.8.
- 为了发现含有谷氨胺的新型聚基酸衍生物.
- 评估分离化合物的生物活性.
主要方法:
- 对*Burkholderia gladioli*ATCC 10248基因组进行生物信息分析.
- 通过in situ促进体插入和异质表达来激活静音BGC.
- 使用HR-ESI-MS和NMR光谱学分离和阐明化合物的结构.
主要成果:
- 他们分离了七种含有谷物胺的类似物,包括五种新化合物 (格拉迪菌素D-H) 和两种已知的化合物.
- 观察到结构的多样性,可能是由于布特化物组的降解.
- 化合物2和4表现出适度的抗炎活性.
结论:
- 基因组挖掘与促进器工程和异质表达相结合,有效地激活沉默的BGCs.
- 这一策略使得新的天然产品,如谷氨胺多基化物 (glutarimide polyketides) 的定向发现成为可能.
- 已识别的化合物需要进一步研究它们的治疗潜力.
