在2020-2022年期间在泰国的废水中检测和描述SARS-CoV-2的分子
Kattareeya Kumthip1, Pattara Khamrin1, Arpaporn Yodmeeklin1
1Department of Microbiology, Faculty of Medicine, Chiang Mai University, Chiang Mai, Thailand; Center of Excellence (Emerging and Re-emerging Diarrheal Viruses), Chiang Mai University, Chiang Mai, Thailand.
Journal of infection and public health
|October 15, 2023
概括
导致COVID-19的病毒SARS-CoV-2在泰国的废水中被检测到. 这一发现表明,在当地爆发期间,三角洲变种在环境水和社区中传播.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 病毒学 病毒学
- 公共卫生监督是对公共卫生的监督.
背景情况:
- 在便和废水中存在SARS-CoV-2,这表明环境监测的潜力.
- 关于SARS-CoV-2在各种环境水域及其遗传特征的数据有限.
研究的目的:
- 调查泰国环境水中的SARS-CoV-2的存在和遗传特征.
主要方法:
- 从泰国清迈的10个地点收集了600个水样 (2020年7月 - 2022年12月).
- 使用实时RT-PCR检测到SARS-CoV-2RNA.
- 测序的ORF1a和S基因用于遗传学分析.
主要成果:
- 在COVID-19爆发期间,在新鲜市场附近的0.17%的废水样本中检测到SARS-CoV-2.
- 鉴定了SARS-CoV-2菌株W323/21与三角洲变种完全相同.
- 在尖端蛋白中确认了D950N突变,这是三角洲变种的特征.
结论:
- 在泰国清迈的废水中证实了SARS-CoV-2Delta变种.
- 在COVID-19爆发期间,表明病毒在环境水和社区的循环.
