使用生物信息学方法和机器学习算法,在精神分裂症的外周血液中识别与免疫相关的生物标志物
Xiaoli Zhu1,2, Chuan-Lan Wang3, Jian-Feng Yu3
1The Key Laboratory of Syndrome Differentiation and Treatment of Gastric Cancer of the State Administration of Traditional Chinese Medicine, Yangzhou University Medical College, Yangzhou, China.
Frontiers in cellular neuroscience
|October 16, 2023
概括
研究人员确定CLIC3是精神分裂症中关键的免疫相关基因. 在大鼠模型中观察到血液和大脑中的CLIC3水平较低,这表明CLIC3是精神分裂症的潜在诊断生物标志物和治疗点.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 精神分裂症是一种复杂的神经发育障碍,具有诊断挑战.
- 外围生物标志物对于改善精神分裂症诊断至关重要.
- 确定特定的遗传和免疫因素是理解精神分裂症的关键.
研究的目的:
- 为了确定精神分裂症的外围诊断生物标志物.
- 研究与免疫相关的基因及其与精神分裂症的关联.
- 在临床前模型中验证潜在的生物标志物.
主要方法:
- 在基因表达数据集上利用权重基因共同表达网络分析 (WCGNA).
- 进行了差异基因表达 (DEG) 分析和丰富分析.
- 使用CIBERSORT进行免疫细胞透分析和机器学习 (随机森林,LASSO,SVM-RFE) 进行基因查.
- 在精神分裂症大鼠模型中验证了发现,并评估了RISPERIDONE的影响.
主要成果:
- 确定了317个与精神分裂症相关的关键基因,主要与免疫过程有关.
- 揭示了免疫细胞群中的显著差异 (乙酸性细胞,巨细胞,巨细胞,T细胞).
- 选了95个与免疫相关的关键基因,并使用机器学习确定了CLIC3作为枢纽基因.
- 在精神分裂症模型大鼠的血和大脑中观察到CLIC3表达的减少,通过RISPERIDONE可逆.
结论:
- 在精神分裂症中,CLIC3被确定为免疫相关的枢纽基因.
- CLIC3可以作为精神分裂症的潜在诊断生物标志物.
- CLIC3代表了精神分裂症治疗的潜在治疗标.
关键词:
网络竞技 网络竞技在 CLIC3 中使用 CLIC3.拉索·拉索 (Lasso) 是一个在WGCNA中,WGCNA是WGCNA.外围免疫相关的生物标志物.随机的森林随机的森林精神分裂症是一种精神分裂症.支持矢量机器的支持矢量机器.更多相关视频
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