在fMRI中基于Web的生理噪声处理:在CBRAIN中添加了PhysIO工具箱
Darius Valevicius1, Natacha Beck1, Lars Kasper2,3
1McGill Centre for Integrative Neuroscience (MCIN), Ludmer Centre for Neuroinformatics and Mental Health, Montreal Neurological Institute (MNI), McGill University, Montreal, QC, Canada.
Frontiers in neuroinformatics
|October 16, 2023
概括
通过整合像PhysIO这样的工具来简化fMRI数据中的生理噪声建模,CBRAIN简化了神经成像分析. 这个网络平台通过直观的界面和高效的数据处理来增强协作研究.
科学领域:
- 神经成像是一种神经成像.
- 计算神经科学是一种神经科学.
- 数据科学数据科学数据科学
背景情况:
- 神经成像研究面临着用复杂的工具分析大型,复杂的数据集的挑战.
- 有效地访问和使用这些工具,特别是在协作环境中,仍然是一个重大障碍.
研究的目的:
- 描述TAPAS PhysIO,一个生理噪声建模工具箱,在CBRAIN网络平台上的集成.
- 突出CBRAIN的基础设施如何促进神经成像研究的多式联络工具集成.
主要方法:
- 利用CBRAIN用户友好的图形用户界面 (GUI).
- 使用大脑成像数据结构 (BIDS) 模式来组织数据.
- 使用浏览器内可视化进行结果审查.
主要成果:
- 简化了PhysIO工具箱的集成,用于fMRI中的生理噪声建模.
- 显著提高了生理预处理的速度,易用性和可扩展性.
- 实现统一和直观的数据分析,用于远程和协作研究.
结论:
- CBRAIN的基础设施有效地支持集成专门的神经成像工具.
- 该平台通过提供可访问和高效的分析工作流来增强协作研究.
- CBRAIN的目标是成为一个关键的开放科学工具,促进整合性神经成像中的FAIR原则.
