在微流体凝珠中进行高通量细菌联合封装,以发现产生抗生素的菌株

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 生物技术是生物技术.
• 分析化学 分析化学

背景情况:

• 生产抗生素的细菌是新型抗菌化合物的宝贵来源.
• 由于微生物的多样性,发现这些产生抗生素的细菌具有挑战性,需要高通量选方法.
• 反对性细菌通过抗生素生产等机制抑制其他微生物的生长.

研究的目的:

• 开发和验证一种高吞吐量微流体方法,用于隔离具有对抗活性的细菌.
• 查产生抗生素的细菌与表达绿色光蛋白 (*E. coli*-GFP) 的大肠杆菌.
• 为了证明该方法在从复杂的微生物混合物中分离罕见菌株的有效性.

主要方法:

• 使用微流体在picoliter凝珠中单个细菌细胞和*E. coli*-GFP的共同封装和共同培养.
• 使用光激活细胞分类 (FACS) 结合显微镜 (明亮场和光) 分析凝珠.
• 显微镜图像与FACS签名 (光散射和光) 的相关性,用于珠子的分类和验证.

主要成果:

• 微流体-FACS方法成功地从混合物中分类了含有对抗性细菌菌株的凝珠.
• 培养分类珠子证实了从墨西哥玉米中分离和恢复两种先前确定的对抗菌株.
• 该方法有效地丰富和隔离了0.01%的稀有抗生素生产菌株.

结论:

• 将光散射和光信号与显微镜联系起来,为高通量微生物相互作用试验提供了强大的控制.
• 这种基于微流体的方法为发现新型抗生素生产微生物提供了强大的工具.
• 开发的方法显著提高了在不同环境中对有益微生物特征的查效率.