大基因组和机器学习的元分析描述了空中抗体特征及其宿主在中国大城市的特征
Dong Wu1,2, Jiawen Xie3, Yangying Liu4
1Shanghai Engineering Research Center of Biotransformation of Organic Solid Waste, School of Ecological and Environmental Sciences, Chongqing Institute of East China Normal University, East China Normal University, Shanghai 200241, P. R. China.
Environmental science & technology
|October 16, 2023
概括
空气传播的抗生素耐药性基因 (ARG) 显示出特定位置的特异性,医院的空气含有独特的耐药性. 携带这些ARG的致病细菌在城市空气中持续存在,造成持续的健康风险.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 城市空气中含有来自不同来源的多种抗生素耐药性基因 (ARG).
- 空中ARG及其宿主的位置特异性和持久性在很大程度上是未知的.
研究的目的:
- 为了研究空中ARG的特定位置.
- 为了确定ARG的病原性宿主是否在城市空气中存在.
- 评估空气传播抗生素耐药性的公共卫生影响.
主要方法:
- 来自136个空气样本的1.2 Tb元基因组序列的分析.
- 从中国的医院,废水处理厂,垃圾填埋场,运输中心和城市地点采样样本.
- 基于机器学习的分类来识别ARG的网站特异性.
主要成果:
- 空载ARG表现出显著的地点特异性,尤其是在医院的空气中.
- 医院的空气中表现出对利法素和 (葡萄糖) 的抗性.
- 环境中普遍存在的ARG,如硫胺和四环素耐药性,是特定于非临床环境的.
- 在城市空气社区中发现了携带现场特征ARG的致病性种群.
- 这些病原体占据了主要的利基,表明了持续的抗生素耐药性危险.
结论:
- 空载ARG是特定于特定地点的,在不同的城市环境中具有不同的配置文件.
- 携带ARG的致病细菌在城市空气中普遍存在,造成持续的健康风险.
- 了解抵抗体的空气传播维度对于公共卫生战略至关重要.
