转录组分析揭示了感染非致命非洲猪瘟病毒的猪的基因表达变化
Wen Feng1,2,3,4,5, Lei Zhou1,2,3,4, Heng Du1,2,3,4
1State Key Laboratory of Animal Biotech Breeding, Beijing, China.
Genetics and molecular biology
|October 16, 2023
概括
非洲猪瘟 (ASF) 病毒感染严重影响了猪产量. 这项研究在响应ASFV的猪中确定了关键的免疫和抗病毒基因,通过分子繁殖提供了通过提高疾病耐受性的见解.
科学领域:
- 兽医病毒学 兽医病毒学
- 动物基因组学 动物基因组学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 非洲猪瘟 (ASF) 对全球猪生产构成重大威胁.
- 非洲猪瘟病毒 (ASFV) 导致ASF,这是一个高度传染性和致命的疾病.
- 了解宿主基因对ASFV的反应对于开发控制策略至关重要.
研究的目的:
- 为了研究感染ASFV的猪的基因表达变化.
- 在多种组织中识别差异表达基因 (DEGs).
- 阐明特定基因在宿主抗病毒反应中的作用.
主要方法:
- 用RNA测序来分析基因表达特征.
- 从受感染的家猪和Landrace × Yorkshire (L/Y) 交叉猪中收集了六种不同的组织类型.
- 差异表达基因 (DEGs) 使用严格的统计标准被确定 (q值<0.05和xLog2foldchange>2).
主要成果:
- 在各种组织中发现了大量的DEGs,包括脏,肝脏,淋巴结,PBMC和脏.
- 基因表达特征在各个组织中各不相同,表明组织特异性的调节功能.
- 关键的免疫和抗病毒基因,如IFIT1,MX1和ISG15,在ASFV感染期间发生了显著的改变.
结论:
- 已识别的DEGs,特别是那些参与免疫和抗病毒途径的DEGs,在宿主对ASFV感染的反应中起着关键作用.
- 这些发现为了解ASFV耐受性机制提供了基础.
- 该研究表明,分子育种策略的潜在目标是提高猪种群中ASF耐药性的.
