一个带有临床元数据和全幻灯片图像的Spitzoid瘤数据集用于深度学习模型
Andrés Mosquera-Zamudio1,2, Laëtitia Launet3, Rocío Del Amor3
1Pathology Department Hospital Clínico Universitario de Valencia, Universidad de Valencia, Valencia, Spain. amosquera@incliva.es.
Scientific data
|October 16, 2023
概括
这项研究介绍了SOPHIE,这是第一个Spitzoid瘤 (ST) 整片图像数据集,有助于深度学习模型诊断这些复杂的黑色素细胞瘤,包括非典型病例.
科学领域:
- 皮肤病理学 皮肤病理学
- 计算病理学计算病理学
- 医学中的人工智能.
背景情况:
- 尖子瘤 (ST) 是一种具有诊断挑战性的黑色素细胞新生体.
- 不确定性仍然存在,特别是对于未知恶性潜力的斯皮茨瘤 (STUMP) 或非典型的斯皮茨瘤.
- 使用全幻灯片成像 (WSI) 诊断黑色细胞瘤现有的深度学习 (DL) 研究是有限的,并且经常排除STUMP.
研究的目的:
- 建立第一个全面的Spitzoid瘤 (ST) 整片图像 (WSI) 的数据集,用于深度学习 (DL) 模型开发.
- 包括多种ST分类:良性,恶性和非典型 (STUMP).
- 为此数据集应用的DL模型提供验证示例.
主要方法:
- 创建SOPHIE:一个新型数据集,包括ST的WSIs和详细的标签 (良性,恶性,非典型/STUMP).
- 包括相关的患者临床信息.
- 实施和解释两个DL模型作为数据库验证的概念验证.
主要成果:
- 开发SOPHIE,这是首个专门针对ST的WSI数据集,包括良性,恶性和STUMP类别.
- 使用SOPHIE数据集展示DL模型性能.
- 建立一个资源,以促进AI在诊断复杂的黑色素细胞瘤.
结论:
- 索菲数据集解决了对Spitzoid瘤DL研究的资源严重缺口.
- 这一数据集促进了人工智能工具的开发和验证,以改善ST的诊断,包括具有挑战性的STUMP病例.
- 索菲准备在皮肤病理学中推进计算病理学.
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