使用高吞吐量微矩阵生物反应器发酵系统减轻大肠杆菌在人体活体结肠模型实验中的花的方法
Harsh Mathur1,2, Monica A Mechoud1,2, Chloe Matthews1,2
1Teagasc Food Research Centre, Moorepark, Fermoy, County Cork, Ireland.
MethodsX
|October 17, 2023
概括
这项研究优化了一种ex vivo结肠模型,用于高通量肠道微生物组分析. 新系统缩短了实验时间,并解决了诸如大肠杆菌 (Escherichia coli) 开花等问题,提高了样品查效率.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 胃肠病学 胃肠病学
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 活体结肠模型对于评估食物和补充剂对肠道微生物的影响至关重要.
- 现有的模型在吞吐量和实验持续时间方面存在局限性,阻碍了大规模的样本选.
- 为了有效评估微生物组调节潜力,需要一个高通量,短时间的模型.
研究的目的:
- 开发和优化使用Applikon微矩阵生物反应器的高通量ex vivo远隔结肠模型.
- 在这个模型中识别导致大肠杆菌 (Escherichia coli) 开花的因素.
- 在ex vivo结肠实验中提供减弱大肠杆菌繁殖的实际解决方案.
主要方法:
- 使用Applikon微矩阵生物反应器进行ex vivo结肠模型实验.
- 优化了对24个样本进行远端结肠发酵的流程.
- 研究导致大肠杆菌过度生长的因素.
- 开发了减轻大肠杆菌繁殖的策略.
主要成果:
- 建立了一个高通量ex vivo结肠模型,实验持续48小时.
- 成功确定了导致大肠杆菌 (Escherichia coli) 繁殖的关键因素.
- 开发并验证了减轻大肠杆菌繁殖的方法,提高了模型可靠性.
- 为用户提供了逐步优化指南.
结论:
- 开发的微矩阵生物反应器系统为高通量ex vivo肠道微生物组研究提供了重大进展.
- 管理大肠杆菌繁殖的有效策略确保了模型的稳定性和可重复性.
- 这种优化的模型有助于有效地选饮食干预措施的肠道微生物组调节潜力.
