来自休息和脱粒化巨细胞的小细胞外囊泡的转录组概况和ceRNA网络
Lihui Lin1, Yuting Liang2, Tianyu Cao3
1Department of Laboratory Medicine, Shanghai General Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai, 200080, P.R. China.
Epigenomics
|October 17, 2023
概括
乳腺细胞小细胞外囊泡 (sEVs) 在休息状态和激活状态之间表现出明显的转录组形状和竞争性内源性RNA (ceRNA) 网络. 这些发现提供了对乳腺细胞sEV分子机制和瘤免疫调节的见解.
科学领域:
- 细胞外囊泡生物学 细胞外囊泡生物学
- 在RNA生物学,RNA生物学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 乳腺细胞 (MCs) 是关键的免疫细胞,参与过敏反应和炎症.
- 微小的细胞外囊泡 (sEVs) 调解细胞间的通信.
- 竞争性内源RNAs (ceRNAs) 通过共享的微RNA (miRNA) 响应元素来调节基因表达.
研究的目的:
- 为了研究巨细胞衍生的sEVs的转录基因格局.
- 在这些SEV中识别竞争性内源RNA (ceRNA) 相互作用.
- 探索不同状态的巨细胞sEVs的分子机制.
主要方法:
- 从静止和脱粒的MC衍生的sEV中对lncRNA,circRNA和mRNA的转录组序列.
- 使用相关性分析和目标基因预测构建ceRNA调节网络.
- 生物信息分析包括差异表达和途径丰富.
主要成果:
- 在休息和降粒的MC-sEV之间显著差异的mRNAs,lncRNAs和circRNAs的表达.
- 涉及lncRNA-miRNA,circRNA-miRNA和miRNA-mRNA相互作用的ceRNA网络的识别.
- 丰富分析表明神经退行,感染和与瘤相关的途径,包括河马和WNT信号的参与.
结论:
- 来自母细胞的sEVs表现出明显的转录组特征和ceRNA调节网络.
- 这些发现提供了对乳腺细胞 sEV 功能有价值的分子见解.
- 这项研究为在疾病背景下调查MC-sEV提供了重要的数据资源,特别是瘤免疫调节.
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