在多祖先表观基因组范围的分析中,在TOPMed MESA中确定了与大动脉增大指数相关的甲基化位点
Xiaowei Hu1, Jeongok G Logan2, Younghoon Kwon3
1Center for Public Health Genomics, University of Virginia, Charlottesville, VA, 22908, USA.
Scientific reports
|October 17, 2023
概括
这项研究探讨了DNA甲基化.
科学领域:
- 心血管表观遗传学 心血管表观遗传学
- 基因组学和精准医学精准医学
- 动脉样硬化研究 动脉样硬化研究
背景情况:
- 动脉硬度 (AS) 和脉动性血液动力学 (PH) 是心血管风险的关键指标.
- 导致AS/PH的表观遗传基础,特别是DNA甲基化模式,尚不清楚.
- 识别这些表观遗传联系对于理解心血管疾病病理生理学至关重要.
研究的目的:
- 调查DNA甲基化与动脉硬性/脉动性血液动力学之间的关联.
- 确定与AS/PH措施相关的特定CpG地点和共甲基化区域.
- 为了发现潜在的表观遗传生物标志物对心血管风险.
主要方法:
- 全表观基因组关联分析 (EWAS) 在TOPMed MESA的多祖先队列上进行.
- 八项AS/PH测量与CpG部位和共甲基化区域相关.
- 后续分析包括基因组丰富和表达量化特征甲基化分析.
主要成果:
- 一个全基因组显著的CpG位点 (cg20711926-CYP1B1) 与大动脉增大指数 (AIx) 有关.
- 三个额外的CpG (cg23800023-ETS1,cg08426368-TGFB3,cg17350632-HLA-DPB1) 被优先考虑为AIx.
- ETS1和HLA-DPB1显示了全血和大动脉组织之间的显著相关性,这表明了潜在的生物标志物作用.
结论:
- DNA甲基化可能在调节与动脉硬和脉动性血液动力学相关的基因中发挥作用.
- 像ETS1和HLA-DPB1这样的特定基因成为理解和潜在调节AS/PH的潜在目标.
- 这些发现有助于理解心血管疾病中的表观遗传机制.
