在Blanco Orejinegro和Romosinuano牛群中发现生长特征的全基因组关联研究
Diego H Bejarano1, Rodrigo A Martínez1, Juan F Rocha2
1Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria -AGROSAVIA. Centro de Investigación Tibaitatá, Km. 14, Mosquera, Cundinamarca, Colombia.
这项研究确定了影响Romosinuano和Blanco Orejinegro品种牛生长特征的关键遗传区域. 这些发现可以改善当地牛群中经济重要生长特征的遗传选择.
科学领域:
- 动物遗传学和动物繁殖
- 量化遗传学 量化遗传学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 增长特征对于当地牛品种的遗传改进至关重要.
- 全基因组关联研究 (GWAS) 对于理解复杂的特征遗传学至关重要.
- 识别生长的遗传标记可以增强牛养殖计划.
研究的目的:
- 进行GWAS,以确定与Romosinuano (ROMO) 和Blanco Orejinegro (BON) 牛的出生体重和随后的生长特征 (断奶,16和24个月) 相关的基因组区域和基因.
- 在确定影响生长的基因组区域内精确定位特定的候选基因.
- 为这些克里奥尔牛品种的未来遗传改进策略提供基础.
主要方法:
- 使用了一步基因组最佳线性无偏预测 (GBLUP) 方法.
- 对596名BON和569名ROMO个体进行了基因型识别,使用的是Illumina BovineSNP50 BeadChip.
- 进行了全基因组关联分析,以确定重要的基因组区域.
主要成果:
- 在不同染色体中确定了25个感兴趣的区域,其中一些与多个生长特征相关,并且对两种品种都有共同之处.
- 基因映射确定了173个注释,包括49个具有已知的与生长相关功能的潜在候选基因.
- 在BTA14 (例如含有PLAG1) 和BTA23 (例如含有KHDRBS2) 上的重要区域因其与两种品种生长特征的关联而被突出.
结论:
- 该研究成功地确定了与ROMO和BON牛中经济重要生长特征相关的基因组区域和候选基因.
- 这些发现有助于理解克里奥尔牛品种生长的遗传结构.
- 鉴定的基因组区域和基因为改善这些牛群的遗传优点预测和选择提供了潜力.
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