使用计算免疫学识别非洲猪瘟病毒pp62多蛋白中的潜在CD8+表位

科学领域:

• 兽医病毒学 兽医病毒学
• 免疫信息学是指免疫信息学.
• 疫苗开发 疫苗开发

背景情况:

• 非洲猪瘟病毒 (ASFV) 是一种高度传染性的DNA树状病毒,在家养猪和野猪中造成高达100%的死亡率.
• ASFV的多蛋白pp62对病毒组合和核心成熟至关重要,其毒性与这种蛋白质有关.
• 对非洲猪瘟 (ASF) 缺乏有效的疫苗导致了全球重大社会经济损失.

研究的目的:

• 在ASFV pp62蛋白中使用in silico分析识别高度保存的细胞毒性T细胞表位.
• 评估这些已识别的表位体作为未来ASFV疫苗的关键组件的潜力.
• 评估候选表位体的免疫性潜力和MHC I结合性.

主要方法:

• 在中获取,聚类和对准pp62序列.
• 对随性结合到猪MHC I等位基因 (IC50 < 500 nM) 的表位基因和阳性蛋白质组/TAP评分的分析.
• 对Sus scrofa domesticus蛋白质和SLA-1*0401.1.的分子对接进行交叉反应性评估.

主要成果:

• 在ASFV pp62蛋白中确定了21种高度保存的CD8+T细胞表位.
• 四个选定的表位体显示出有前途的结合亲和力和潜在的免疫性.
• 分子对接证实了候选表位和猪白细胞抗原-1*0401.1.之间有利的结合相互作用.

结论:

• 已识别的保存的CD8+表位是ASFV疫苗开发的有希望的候选人.
• 这些发现为未来的体外和体内研究提供了基础,以验证疫苗的疗效.
• 这项研究为控制非洲猪瘟的破坏性影响迈出了重要一步.