大规模生物信息学研究格拉斯皮米迪和Albusimiditide的结构特征

科学领域:

• 自然产品化学 自然产品化学
• 生物有机化学 生物有机化学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• Graspetides 是通过核糖体合成和转化后修改的 (RiPPs) 具有多样化的链接.
• 草类的子集经历了aspartimidylation,这是由O-甲基转移酶催化的一种修饰,主要是在Actinomycetota.

研究的目的:

• 为了进行一个全面的生物信息分析的 graspetides与aspartimide,称为 graspimiditides.
• 描述来自*Streptomyces albus* J1074.的代表性草皮胺的结构和特性.

主要方法:

• 对5000个甲基转移酶序列的生物信息分析,以识别假设的草胺.
• 序列相似性聚类来分类已识别的.
• 使用双重质谱,水解和氨基酸替代,对albusimiditide的实验性表征.

主要成果:

• 识别了962种独特的假定草皮,分为八个主要集群.
• 发现氏胺是单体,而氨基胺属于较小的集群.
• 将阿尔布西米迪化成一个大型四环,具有四个 ω-链接和一个阿斯巴蒂,形成一个茎环结构.
• 在实验室中对albusimiditide的aspartimide进行水解,以3:1的比例产生异酸盐和酸盐.

结论:

• 这项研究提供了一个全面的概述的多样性和结构特征的 graspimiditides.
• 这些发现为未来对这种独特的自然产品类别的研究奠定了基础.
• 阿尔布西米迪提德作为理解格拉斯皮米迪提德结构和修饰的模型.