基于阵列的年龄预测模型应用于死后组织样本

科学领域:

• 法医科学 法医科学 法医科学
• 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• DNA甲基化模式与时间年龄有很强的相关性.
• 基于甲基化数据的表观遗传钟是预测年龄的宝贵工具.
• 这些时钟在法医调查中有潜在的应用,用于识别未知的个人.

研究的目的:

• 在韩国人口中评估现有的基于DNA甲基化的年龄预测模型的性能.
• 评估9种不同的死后组织类型的年龄预测准确性.
• 研究DNA数量和质量对年龄预测模型的影响.

主要方法:

• 从20名韩国人 (年龄在18-78岁之间) 收集了180个死后组织样本.
• 使用Infinium MethylationEPIC阵列进行DNA甲基化分析.
• 测试了多个已建立的基于阵列的年龄预测模型,包括全组织,组织特定,汉纳姆,皮肤和血液,张,PhenoAge和MEAT时钟.

主要成果:

• 全组织时钟显示中等准确度 (MAE=8.7年).
• 汉努姆,皮肤与血液和张钟在血液样本 (MAE <5年) 中实现了高精度.
• 肌肉特定的MEAT时钟在肌肉组织中显示出高精度 (MAE=4.7年).
• 模型在韩国人中表现良好,尽管在欧洲队伍中先前有发展.
• 在低DNA数量和碎片化条件下,年龄预测仍然强大.

结论:

• 已建立的表观遗传时钟在韩国死后组织中有效预测年龄.
• 组织特定的时钟为相关样本类型提供了高精度.
• 基因甲基化年龄预测模型是有价值的法医工具,即使有受损的DNA样本.