开发抗微生物数据库版本1以提供手工策划的AMP的全面和详尽的资源
Rajat Kumar Mondal1, Debarup Sen2, Ankish Arya1
1Biochemistry and Bioinformatics Laboratory, Department of Applied Sciences, Indian Institute of Information Technology Allahabad (IIIT-A), Uttar Pradesh, Devghat, Jhalwa, Prayagraj, 211012, India.
Scientific reports
|October 19, 2023
概括
抗微生物数据库 (AMPDB v1) 为抗微生物研究提供了一个全面的,手工策划的资源,具有先进的搜索工具和超过59,000条条目.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 药物发现 药物发现 药物发现
背景情况:
- 现有的抗微生物数据库存在局限性.
- 需要一个全面的,用户友好的资源,用于抗微生物研究.
研究的目的:
- 为了引入抗微生物数据库版本1 (AMPDB v1).
- 提供精心策划的资源,为抗微生物研究提供先进的工具.
主要方法:
- 从可用资源中手动整理数据.
- 集成用于序列对齐和蛋白质特征计算的Web应用程序.
- 开发先进的搜索和浏览功能.
主要成果:
- AMPDB v1包含了59122个条目,分为88个类别.
- 集成的工具提供实时序列对齐和蛋白质特征计算.
- 增强的搜索选项包括可定制的高级搜索功能.
结论:
- AMPDB v1 解决了现有数据库的局限性.
- 该数据库为抗微生物研究提供了一个强大的,用户友好的平台.
- 在https://bblserver.org.in/ampdb/.上可以在线访问AMPDB v1.
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