YY1 绑定到缺乏增强活性的监管元素 促进局部折叠和基因激活
Zeqian Gao1, Miao Wang1, Alastair Smith1
1School of Molecular and Cellular Biology, Faculty of Biological Sciences, University of Leeds, Leeds LS2 9JT, UK.
研究人员发现了结合YY1蛋白的新型基因组组织元素. 这些元素对于基因调节和增强剂-促进剂相互作用至关重要,特别是在免疫球蛋白lambda locus.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
背景情况:
- 增强剂-促进剂相互作用对基因调节至关重要,但建立这些连接的机制尚未完全理解.
- 凝聚素介导的循环挤出是相关的,但可能不是唯一的机制.
- 正在积极研究特定DNA结合蛋白在基因组组织中的精确作用.
研究的目的:
- 确定涉及基因组组织和增强剂-促进剂相互作用的新型调控元素.
- 研究转录因子YY1在建立这些相互作用中的作用.
- 探索缺乏内在增强活性的元素在局部调节中的功能.
主要方法:
- 在小鼠免疫球蛋白兰巴 (Igλ) 轻链位点内识别和表征调控元素.
- 使用针对YY1结合位的淘汰策略对特定元素 (HSCλ1) 的功能分析.
- 在小鼠胚胎干细胞中对YY1结合元素进行全基因组分析.
主要成果:
- 确定了一种具有调节潜力的元素 (HSCλ1),但缺乏内在增强剂/促进剂活性.
- 在HSCλ1中破坏YY1结合部位显著降低了Igλ转录,并改变了增强剂/促进剂相互作用.
- 全基因组分析显示,在CTCF/凝聚环边界内,有许多YY1结合的元素缺乏内在增强剂活性.
结论:
- 即使没有内在的增强剂活性,YY1结合的元素在位置折叠中也发挥着基本作用.
- 这些元素对于促进增强剂-促进剂相互作用至关重要,有助于基因调节.
- 这些发现提出了基因组组织和基因调节的新模型,涉及特定的DNA结合蛋白.
更多相关视频
11:32Identification of Transcription Factor Regulators using Medium-Throughput Screening of Arrayed Libraries and a Dual-Luciferase-Based Reporter
Published on: March 27, 2020
11:36Author Spotlight: An Integrated Workflow to Study the Promoter-Centric Spatio-Temporal Genome Architecture in Scarce Cell Populations
Published on: April 21, 2023
相关概念视频
Cooperative Binding of Transcription Regulators
Co-activators and Co-repressors
Master Transcription Regulators
RNA Polymerase II Accessory Proteins
Regulation of Expression Occurs at Multiple Steps
Cis-regulatory Sequences
