用高通量自动化工作流程对尿液细胞外膀进行无人手的蛋白质分析
Zheng-Chi Lee1,2, Marco Hadisurya2, Zhuojun Luo2
1West Lafayette Junior/Senior High School, West Lafayette, Indiana 47906, United States.
Journal of the American Society for Mass Spectrometry
|October 23, 2023
概括
一个新的自动化工作流程增强了细胞外囊泡 (EV) 处理,用于疾病生物标志物发现. 这种高通量方法改善了EV隔离和蛋白质提取,使得癌症的早期诊断更快,更可靠.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 细胞外囊泡 (EVs) 对非侵入性疾病生物标志物发现有价值.
- 目前的电动汽车隔离方法面临着诸如低产量,低速和低效率等挑战.
- 这些局限性阻碍了EVs的临床应用.
研究的目的:
- 开发一个高通量自动化工作流程,用于EV隔离,溶解,蛋白质提取和变性.
- 克服现有的手动EV处理方法的局限性.
- 从临床样本中进行EV的高效和可重复的蛋白质组分析.
主要方法:
- 开发了一种并行,自动化的工作流程,用于从临床尿样处理EV.
- 集成的EV隔离,溶解,蛋白质提取和变质化步骤.
- 用蛋白质覆盖的珠子用于下游分析方法,如免疫试验和质谱.
主要成果:
- 自动化协议证明了可复制和强大的蛋白质量定量,变化系数中位数低于10%.
- 在临床样本中确定了3793种独特的蛋白质和40380种独特的.
- 在癌患者中发现了992种明显升调的蛋白质,这些蛋白质参与了关键的代谢途径.
结论:
- 无手工作流提供了对EV提取和配置的实用方法.
- 这种方法简化了生物标志物发现,瘤监测和早期癌症诊断.
- 自动化系统增强了EV用于诊断和研究的临床实用性.
