P450Rdb:由细胞P450酶催化反应的手动策划数据库
Yang Zhang1, Xianrun Pan2, Tianyu Shi3
1Innovative Institute of Chinese Medicine and Pharmacy, Academy for Interdiscipline, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, Chengdu 611137, China.
P450Rdb数据库提供了手工策划的P450 (P450) 酶及其反应资源,有助于各种生物和工业应用中的研究.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 酶学 是一种酶学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 细胞染色体P450 (P450) 酶是生物代谢和生物合成中的关键催化剂.
- 尽管已知有超过30万个P450基因,但只有不到0.2%的基因具有功能性特征.
- 关于P450酶功能和催化反应存在重大知识差距.
研究的目的:
- 建立P450Rdb,一个手动策划的P450酶及其反应数据库.
- 为P450相关信息提供一个集中,可访问的平台.
- 通过编译文献支持的P450反应来促进研究.
主要方法:
- 从科学文献和现有数据库中对P450s和反应的手动策划.
- 根据类型和部位对P450反应的组织和分类.
- 使用HTML,PHP和MySQL开发一个用户友好的网站.
主要成果:
- 目前,P450Rdb包含1600多个反应,涉及200多种物种的590多种P450.
- 该数据库提供了一个用户友好的界面,用于查询,浏览和分析P450数据.
- 在http://www.cellknowledge.com.cn/p450rdb/.中可以自由访问P450Rdb.
结论:
- 预计P450Rdb将大大推动P450酶结构和功能的研究.
- 该数据库将支持天然产品合成和制药工程方面的进步.
- P450Rdb将促进生物技术,农业和化学工业的进步.
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