安达:一种开源工具,用于 in vitro 神经元细胞的自动图像分析
Hallvard Austin Wæhler1,2,3, Nils-Anders Labba1,4,2, Ragnhild Elisabeth Paulsen4,2
1Institute of Basic Medical Sciences, Department of Molecular Medicine, Faculty of Medicine, University of Oslo, Blindern, 1112, 0317, Oslo, Norway.
BMC neuroscience
|October 24, 2023
概括
自动化神经元发育分析 (ANDA) 通过活细胞成像量化神经元形态. 这个开源工具有效地分析了各种物种的细胞数量,神经元长度和附着点.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 细胞生物学 细胞生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 神经区分成像提供了对发育的见解.
- 活细胞成像产生大型数据集,需要自动分析.
- 对神经元形态学的定量分析至关重要.
研究的目的:
- 开发一个自动化工作流程来量化神经元形态.
- 为了使体外神经元细胞类型的高通量分析.
- 为神经元发育研究提供多功能和高效的工具.
主要方法:
- 开发自动化神经发育分析 (ANDA) 工作流程.
- 对神经元细胞数量,神经元长度和神经元附着点的量化.
- 适用于各种体外模型,包括,老鼠,小鼠和人类细胞.
主要成果:
- 安达自动化了关键神经元形态指标的分析.
- 该工具在多种物种中展示了准确性,多功能性和效率.
- 对高通量活细胞成像屏幕的成功应用.
结论:
- 安达是一个开源的,用户友好的工具,用于自动化神经元细胞分析.
- 管道有效地处理时间过程测量.
- 安达在分析高通量成像屏幕方面特别强大.
