用肺癌患者的代谢放射基因组数据对FDG PET/CT进行批次校正方法的比较分析

科学领域:

• 医疗成像医学成像
• 基因组学就是基因组学.
• 无线电学 (Radiomics) 是一种辐射学.

背景情况:

• 放射学研究面临着由于各种仪器的批量效应带来的挑战.
• 标准化放射基因组数据对于肺癌的可靠分析至关重要.

研究的目的:

• 为了比较三种批量效应校正方法 (幻影,ComBat,Limma) 的氧糖 (FDG) PET/CT放射基因组数据.
• 评估这些纠正对图像纹理特征和基因突变之间的关联的影响.

主要方法:

• 从肺癌患者的FDG PET/CT图像和基因组数据的回顾性分析.
• 幻影校正,ComBat和Limma方法应用于纹理和基因组特征.
• 批量效应的评估使用主要成分分析 (PCA),k-近邻批量效应测试 (kBET) 和轮得分.

主要成果:

• 康巴特和林玛方法有效地减少了批量效应,它们之间没有显著差异.
• 与未经纠正的数据相比,幻影校正导致较低的kBET拒绝率和轮得分.
• 康巴特和林玛纠正的数据显示,纹理特征与TP53突变之间的关联比幻影纠正的数据更为显著.

结论:

• 康巴特和林玛方法是有效的,或者同样有效的,作为幻影校正,以减少肺癌放射基因组数据中的批量效应.
• 这些先进的校正方法提高了放射遗传学关联的发现,特别是TP53突变.