洞察下一代测序指导抗体选择策略的洞察力
M Frank Erasmus1, Fortunato Ferrara2, Sara D'Angelo2
1Specifica LLC, a Q2 Solutions Company, Santa Fe, USA. ferasmus@specifica.bio.
Scientific reports
|October 26, 2023
概括
下一代测序 (NGS) 通过提供对抗体多样性的更深入的见解和改善选择来增强治疗性抗体的发现. 虽然CDR频率和亲和力之间的直接相关性很弱,但NGS聚类有助于优先考虑抗体候选人.
科学领域:
- 生物技术是生物技术.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 药物发现 药物发现 药物发现
背景情况:
- 治疗性抗体的发现使用了体外显示方法来识别主要候选人.
- 通过桑格测序进行传统的多样性评估具有固有的局限性.
- 下一代测序 (NGS) 为全面的多样性分析提供了一种具有成本效益和高深度的替代方案.
研究的目的:
- 制定使用NGS在抗体药物发现中的准则.
- 展示NGS在扩大抗体多样性指标方面的优势.
- 通过全面的排序,改进领先的优先级策略.
主要方法:
- 实施NGS用于抗体库的高通量测序.
- 分析NGS数据以评估多样性,独特集群和抗体特征.
- 研究CDR频率与抗体亲和力之间的相关性.
主要成果:
- NGS显著扩大了独特的HCDR3集群,并识别了更广泛的高亲和抗体,识别了各种各样的表位.
- NGS提高了抗体候选人的优先级.
- 在CDR频率和抗体亲和力之间观察到令人惊的缺乏直接相关性.
结论:
- 对于治疗性抗体的发现,NGS提供了巨大的好处,增强了多样性评估和选.
- 利用NGS集群和丰度分析可以减轻亲和力预测的局限性.
- 这项研究为优化NGS在抗体发现工作流程中的实施提供了建议.
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