动物代谢物数据库:动物组织中的代谢物度和量化代谢数据的方便比较

科学领域:

• 代谢学 代谢学 代谢学
• 生物信息学是一种生物信息学.
• 进行比较基因组学.

背景情况:

• 定量代谢学数据对于理解生物系统至关重要.
• 现有的数据库往往缺乏全面的比较数据或用户友好的分析工具.
• 动物代谢物数据库 (AMDB) 是为了解决这些局限性而开发的.

研究的目的:

• 建立一个免费访问的数据库,用于从动物样本中获得的定量代谢学数据.
• 为数据比较和探索提供综合统计分析工具.
• 作为一个社区平台,用于在代谢学中存储和交换数据.

主要方法:

• 精选的定量代谢学数据,包括代谢物度 (nmol/g湿重).
• 与样本元数据一起包括原始NMR和MS数据.
• 开发用于数据浏览和比较的内置统计分析工具.

主要成果:

• 美国脊椎动物代谢数据库 (AMDB) 拥有定量代谢数据,主要来自脊椎动物眼镜和血液,其覆盖范围扩大到其他组织 (肌肉,心脏,肝脏,大脑).
• 数据包括每个样本60-90个丰富的代谢物的度.
• 数据库侧重于代谢物度,促进直接的生物解释.

结论:

• AMDB为各种领域的研究人员提供了宝贵的资源,包括动物建模,药物开发和环境科学.
• 该数据库有助于在动物模型中研究典型代谢物基线度.
• 美国代谢开发银行 (AMDB) 在代谢学社区内促进数据共享和协作.