综合性转录和蛋白质组学分析揭示了牛病毒性腹病毒-1-感染周围血液单核细胞中的免疫反应过程
Kang Zhang1,2, Jingyan Zhang2, Lei Wang1,2
1College of Veterinary Medicine, Gansu Agricultural University, Lanzhou 730070, China.
Veterinary sciences
|October 27, 2023
概括
牛病毒性腹病毒 (BVDV) 显著影响牛的健康和经济. 这项研究使用RNA-seq和iTRAQ分析了BVDV-1感染的免疫细胞,揭示了宿主病毒相互作用中的关键基因和蛋白质变化.
科学领域:
- 兽医病毒学 兽医病毒学
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 蛋白质组学和基因组学
背景情况:
- 牛病毒性腹病毒 (BVDV) 在畜牧业造成重大经济损失.
- 周围血液单核细胞 (PBMC) 是关键的免疫细胞,也是BVDV感染的目标.
研究的目的:
- 为了阐明宿主-BVDV-1相互作用的动态.
- 在BVDV-1感染的PBMC中识别差异表达基因 (DEGs) 和蛋白质 (DEPs).
主要方法:
- 用于转录学学的RNA测序 (RNA-seq).
- 为蛋白质组学提供相对和绝对量化 (iTRAQ) 的同位素标签.
- 定量逆转录酶-聚合酶连锁反应 (qRT-PCR) 和并行反应监测 (PRM) 用于验证.
主要成果:
- 在感染后12小时确定了344个DEG (234个下调,110个上调) 和446个DEP (224个下调,222个上调).
- 丰富分析揭示了免疫相关途径的显著改变,如抗原处理,补充级联和细胞因子信号传递.
- 下调的基因/蛋白质与IL-17,PI3K-Akt和TNF信号通路有关,而上调的基因/蛋白质与代谢通路和RIG-I类受体信号相关.
结论:
- 这项研究提供了PBMCs中BVDV-1感染的全面的转录和蛋白质组数据集.
- 确定的DEG和DEP突出显示了免疫系统内复杂的宿主病毒冲突.
- 这些数据作为进一步研究BVDV与主机交互机制的基础.


