斑马鱼中脱氧尼瓦伦醇 (DON) 诱导的肝脏和肠道毒性的转录组分析:对基因表达和潜在的解毒途径的洞察
Feng Yao1, Miaomiao Zhao1, Yaowen Du1
1College of Biological and Chemical Engineering, Zhejiang University of Science and Technology, Hangzhou 310023, China.
Toxins
|October 27, 2023
概括
脱氧尼瓦伦醇 (DON) 显著改变斑马鱼肝脏和肠道中的基因表达. 这项研究揭示了长非编码RNA和信使RNA的广泛变化,影响了关键的生物通路.
科学领域:
- 毒素基因组学 毒素基因组学
- 斑马鱼模型的模型
- 分子毒理学分子毒理学
背景情况:
- 脱氧尼瓦伦醇 (DON) 是一种普遍存在的真菌毒素,具有已知的不良影响.
- 了解DON对水生生物的影响对于环境和食品安全至关重要.
- 斑马鱼为研究毒理机制提供了有价值的模型,因为它们与哺乳动物的遗传相似性和快速发展.
研究的目的:
- 为了研究脱氧尼瓦伦醇 (DON) 暴露对斑马鱼肝脏和肠道的转录效应.
- 在对DON的反应中识别差异表达基因 (DEGs) 和长非编码RNA (lncRNAs).
- 阐明受DON毒性影响的生物过程和信号通路.
主要方法:
- 用RNA测序 (RNA-seq) 来分析mRNA和lncRNA的表达特征.
- 进行了基因本体学 (GO) 分析,以注释已识别的DEGs的功能.
- 基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 路径分析被用来绘制受影响的信号路径.
主要成果:
- 暴露于DON导致了lncRNA表达的显著改变,在肠道中产生数千个上下调节的DEG,在肝脏中产生数百个.
- mRNA分析显示,斑马鱼的两个器官中都有大量的上下调节的基因.
- 对GO的分析表明,在RNA剪接和MAP激酶活性等过程中进行了丰富,而KEGG途径包括C型莱克受体和NOD类受体信号传递.
结论:
- 在斑马鱼肝脏和肠道中,DON在mRNA和lncRNA水平上显著影响基因表达.
- 这些发现提供了对DON的毒理机制和潜在的解毒途径的见解.
- 这种转录基因分析突出了斑马鱼在真菌毒素毒理学研究中的有用性.
