牙周炎和肝细胞癌之间潜在的共同分子机制:生物信息分析和验证
Xiaomiao Fan1, Zimin Song2, Wenguang Qin1
1Department of Periodontics, Affiliated Stomatology Hospital of Guangzhou Medical University, Guangdong Engineering Research Center of Oral Restoration and Reconstruction, Guangzhou Key Laboratory of Basic and Applied Research of Oral Regenerative Medicine, Guangzhou, P.R. China.
Cancer genomics & proteomics
|October 27, 2023
概括
牙周炎或牙损失可能通过改变免疫反应和细胞功能来影响肝细胞癌 (HCC) 的发展. 作为HCC预后的生物标志物,MSH2,GRAMD1C和CTHRC1显示出有希望的结果.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 口腔医学是指口腔医学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 肝细胞癌 (HCC) 是一种流行性肝癌,预后不佳.
- 牙周炎越来越多地与肝癌发生和不良HCC结果有关.
研究的目的:
- 调查牙周炎和HCC之间的关联.
- 识别交叉对话机制和潜在的生物标志物.
主要方法:
- 对差异表达基因 (DEGs) 的基因表达综合 (GEO) 数据集的分析.
- 构建一个竞争的内源RNA (ceRNA) 网络.
- 机器学习的应用 (LASSO,随机森林,SVM-RFE) 用于诊断和预后标记物的识别.
- 使用定量实时PCR (qRT-PCR) 和免疫组织化学 (IHC) 验证.
主要成果:
- 一个ceRNA网络揭示了与免疫/炎症反应,细胞循环和肝脏代谢的关联.
- DEGs在HCC中显示出诊断意义.
- MSH2,GRAMD1C和CTHRC1被确定为HCC的显著预后.
- 这些基因的表达在HCC组织中得到了验证.
结论:
- 牙周炎可能通过免疫,炎症,细胞循环和代谢途径影响HCC的发生.
- MSH2,GRAMD1C和CTHRC1是肝细胞癌的潜在预后生物标志物.
