剪接调节器SR45增加的DNA甲基化抑制了litchi中的种子流产

科学领域:

• 植物生物学 植物生物学
• 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
• 分子遗传学 分子遗传学

背景情况:

• 种子的发育是由复杂的基因网络调节的.
• DNA甲基化在种子发育中的作用在很大程度上是未知的.
• (Litchi chinensis) 是一种重要的水果作物,具有复杂的种子发育.

研究的目的:

• 为了研究DNA甲基化在李子种子发育中的作用.
• 在这个过程中识别通过DNA甲基化调节的基因.
• 描述LcSR45在种子发育中的功能.

主要方法:

• 单基分解力甲基组分析.
• 不同甲基化分析. 差异甲基化分析.
• 权重基因同表达网络分析 (WGCNA).
• 基因沉默和子宫外表达研究.
• 替代拼接分析. 替代拼接分析.

主要成果:

• 在李奇种子发育过程中,CHH甲基化显著增加.
• 包括LcSR45在内的46个候选基因被确定为受DNA甲基化调节的.
• LcSR45是一种富含氨酸/氨酸 (SR) 的拼接调节器同类物,显示促进物CHH甲基化的增加.
• 沉默LcSR45改善了一种利奇种的种子发育.
• 在Arabidopsis的子宫外LcSR45表达导致了种子流产.
• LcSR45调节了参与种子发育的基因的替代拼接.

结论:

• LcSR45是高甲基化,在利奇种子的发育中起着有害作用.
• 在李奇种子发育过程中,DNA甲基化,特别是CHH甲基化,在全球范围内增加.
• LcSR45介导的替代剪接是影响种子发育的关键机制.