在新生儿重症监护病房爆发期间,应用下一代测序对Enterobacter Hormaechei亚种分析

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 传染性疾病 传染性疾病

背景情况:

• 肠杆菌 (ECC) 综合体包括新生儿病原体,经常与医院血流感染有关.
• 在ECC物种中的基因组异质性使疫情识别和克隆性确定复杂化.
• 传统方法的局限性,如脉冲场凝电泳,阻碍了精确的ECC菌株分化.

研究的目的:

• 评估将下一代测序 (NGS) 纳入疫情管理战略的临床实用性.
• 在3级新生儿重症监护室 (NICU) 中,在ECC爆发期间加强患者护理.

主要方法:

• 细菌全基因组测序 (WGS) 在殖民新生儿的ECC分离物上进行.
• 分析了家族遗传关系,抗微生物耐药性基因和移动遗传元素.
• 标准护理包括每周进行微生物扫描和内肌分泌分析.

主要成果:

• 尽管有类似的抗微生物敏感性模式,但WGS发现了四种不同的ECC克隆.
• 隔离物被描述为Enterobacter hormaechei亚种,其中包括steigerwaltii, hoffmannii和oharae.
• 没有发现疫情的环境来源.

结论:

• 对抗生素敏感性模式在调查多药耐药ECC疫情时可能会产生误导性.
• 细菌WGS提供了对ECC的精确克隆级别识别,这对于疫情划分至关重要.
• 一个新的标准化操作程序,涉及家长和医疗专业人员,成功地阻止了进一步的ECC传播.