选择适合的参考基因用于RT-qPCR基因表达分析在不同无生物压力下的百叶草中

科学领域:

• 植物科学 植物科学
• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 是一个遗传学.

背景情况:

• 百叶草 (Eremochloa ophiuroides) 是一种有弹性的C4草草. 准确的基因表达分析需要稳定的参考基因,特别是在压力下.
• 诸如盐,寒冷,干旱,和除草剂等非生态压力显著影响植物生理学和基因表达.

研究的目的:

• 在各种非生物压力条件下,选和验证百叶草叶中最稳定表达的参考基因.
• 为数量化基因表达研究提供可靠的参考点.

主要方法:

• 使用定量实时PCR (RT-qPCR) 来评估13个候选参考基因的表达稳定性.
• 基因表达稳定性使用多个软件包进行了评估:GeNorm,NormFinder,BestKeeper和ReFinder.
• 通过评估与非生物性压力相关的基因 (PIP1,PAL,COR413,ALMT9,BAR) 来验证所选参考基因的表达.

主要成果:

• 无素结合酶 (UBC) 基因在寒冷和压力下表现出最高的稳定性.
• 酸脱酶 (MD) 基因在盐和干旱压力下表现最好.
• 60S核糖体蛋白L2 (RIP) 基因在除草剂压力下是最稳定的.

结论:

• 这项研究成功地在各种非生物压力下,成功地确定了百叶草的特定,稳定的参考基因.
• 这些发现对于准确的基因表达概况和理解百叶草中的压力反应至关重要.
• 经过验证的参考基因将提高未来分子研究在这个重要的草草物种的可靠性.