2009年至2022年间塞内加尔3型登革热病毒的分子进化:分散模式和预防和治疗对策的影响
Idrissa Dieng1, Diamilatou Balde1, Cheikh Talla2
1Arboviruses and Haemorrhagic Fever Viruses Unit, Virology Department, Institut Pasteur de Dakar, Dakar 220, Senegal.
Vaccines
|October 28, 2023
概括
自2009年以来,三型登革热病毒 (DENV-3) 在塞内加尔已经演变,表明遗传多样性影响了疫苗的有效性. 基因组监测对于非洲未来的登革热预防战略至关重要.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 基因组学就是基因组学.
- 流行病学 流行病学
背景情况:
- 登革热病毒 (DENV) 是全球主要的一种树状病毒性疾病.
- 2009年,DENV-3在塞内加尔引发了第一个城市流行病,在西非对其遗传演变的数据有限.
研究的目的:
- 从2009年到2022年,在塞内加尔调查DENV-3的分子进化和遗传多样性.
- 评估DENV-3遗传多样性对疫苗疗效的影响.
主要方法:
- 使用纳米孔序列测序进行了植物遗传学和植物地理学分析.
- 与历史样本一起测序36个新的DENV-3菌株.
- 病毒基因组中的氨基酸变化与疫苗菌株的比较.
主要成果:
- 塞内加尔的DENV-3菌株属于基因型III,有来自亚洲和布基纳法索的三个独立引入的证据.
- 与疫苗菌株相比,在CprM-E区域中发现了重要的氨基酸替代,特别是在E基因的ED-III域中.
- 遗传多样性影响了当前登革热疫苗候选人的有效性.
结论:
- 塞内加尔的DENV-3演变需要更新的疫苗接种策略.
- 基因组流行病学对于了解非洲新出现的病原体至关重要.
- 建议建立一个泛非洲网络,对登革热病毒进行基因组监测.


