协议从非怀孕和怀孕的小鼠子宫组织分离表皮,用于单细胞RNA测序
ShanmugaPriyaa Madhukaran1, Gary C Hon2, Mala Mahendroo1
1Department of Obstetrics and Gynecology, University of Texas Southwestern Medical Center, Dallas, TX 75390, USA; Cecil H. and Ida Green Center for Reproductive Biology Sciences, University of Texas Southwestern Medical Center, Dallas, TX 75390, USA.
STAR protocols
|October 28, 2023
概括
这项研究提出了一个新的协议,用于解离小鼠宫细胞,用于单细胞RNA测序. 这种方法有效地隔离所有上皮细胞亚群,包括敏感的杯状细胞,进行详细的生物学研究.
科学领域:
- 生殖生物学 生殖生物学
- 细胞生物学 细胞生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 在单细胞水平上研究宫上皮细胞生物学是具有挑战性的.
- 差异化亚型,如粘液分泌杯状细胞,对解离酶敏感.
- 这种敏感性阻碍了所有上皮亚群的隔离.
研究的目的:
- 开发和介绍一项用于分离小鼠宫组织的协议.
- 为了使所有宫上皮细胞亚群的单细胞RNA测序.
- 为了克服分离敏感细胞类型的挑战.
主要方法:
- 从非怀孕和怀孕的小鼠收集和准备子宫组织.
- 使用精细的酶法解离子宫细胞.
- 执行可行性检查,图书馆准备和排序.
- 概述了单细胞RNA测序数据分析的程序.
主要成果:
- 该协议成功地分离了子宫上皮质,用于单细胞RNA测序.
- 它允许分离以前难以获得的上皮细胞亚群,包括杯状细胞.
- 该方法适用于怀孕和非怀孕的小鼠宫组织.
结论:
- 本方案促进了宫上皮的单细胞综合分析.
- 它克服了酶敏感性问题,使宫细胞生物学能够得到更广泛的研究.
- 这一进步有助于更深入地了解宫组织功能和疾病.
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