在人类动脉样硬化中循环RNA的微阵列表达特征和生物信息分析
Yu Zhou1, Huoying Cai1, Lin Huang1
1Division of Vascular Surgery, National-Guangdong Joint Engineering Laboratory for Diagnosis and Treatment of Vascular Disease, The First Affiliated Hospital, Sun Yat-sen University, Guangzhou, People's Republic of China.
Pharmacogenomics and personalized medicine
|October 30, 2023
概括
循环RNAs (circRNAs) 涉及到动脉样硬化 (ASO),这是一种导致下肢截肢的疾病. 这项研究确定了ASO动脉中差异表达的circRNA,揭示了它们在疾病进展中的潜在作用.
科学领域:
- 血管生物学 血管生物学
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 整形动脉样硬化 (ASO) 是非创伤性下肢截肢的主要原因.
- 循环RNAs (circRNAs) 越来越多地被认为是它们在心血管疾病中的调节作用,但它们在ASO病变发生中的具体参与仍然不清楚.
研究的目的:
- 为了研究动脉样硬化 (ASO) 动脉中circRNAs的表达特征.
- 阐明在ASO中由差异表达的circRNAs调节的潜在分子机制和途径.
主要方法:
- 微阵列分析被用来比较正常和ASO下肢动脉之间的circRNA表达.
- 生物信息学工具,包括KEGG通路分析,用于预测差异表达circRNAs (DE circRNAs) 的功能和相互作用.
- 用RT-qPCR验证了被选中的DE circRNAs的表达水平.
主要成果:
- 总共有12,735个circRNA被确定,其中在ASO动脉中发现了1196个DE circRNA (276个上调,920个下调).
- 通过RT-qPCR确认了特定circRNAs的差异表达,例如调高hsa_circ_0003266和调低hsa_circ_0091934.
- DE circRNAs与包括MAPK信号传递在内的途径有关,并富含蛋白质结合和器官组织等功能.
结论:
- 这项研究提供了人类ASO动脉中circRNA表达的全面概述.
- 这些发现突出了circRNA及其相关网络在ASO的发展和进展中的潜在调节作用.
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