使用机器学习工具对来自Tinospora cordifolia的循环氧化酶抑制剂进行虚拟查和邀请评估

科学领域:

• 植物化学 植物化学
• 计算化学的计算化学
• 药理学 药理学是指药理学的学科.

背景情况:

• Tinospora cordifolia拥有多种植物化学物质,具有潜在的抗炎和抗氧化特性.
• 循环氧化酶 (COX) 酶是抗炎药物开发的关键标.

研究的目的:

• 为了识别Tinospora cordifolia叶片提取物中具有潜在抗炎活性的化合物.
• 使用计算方法评估这些化合物对COX-1和COX-2酶的抑制潜力.

主要方法:

• 气相色谱-质谱 (GC-MS) 用于代谢物识别.
• 机器学习,分子对接和分子动力学 (MD) 模拟用于虚拟选和稳定性分析.
• 在体外测试包括DPPH,ABTS,氧化,抗菌剂,COX和LOX抑制.

主要成果:

• 在GC-MS分析中,在T. cordifolia叶提取物中发现了各种代谢物.
• 分子对接确定了7,9-Di-tert-butyl-1-oxaspiro (4,5) deca-6,9-diene-2,8-dione作为一种强大的COX-1和COX-2抑制剂,其结合能分别为-7.1和-6.8kcal/mol.
• MD模拟证实了化合物-酶复合物的稳定性超过100 ns,具有较低的RMSD值.

结论:

• 7,9-Di-tert-butyl-1-oxaspiro (4,5) deca-6,9-diene-2,8-dione是一种有前途的COX酶的双抑制剂.
• 这种化合物表现出类似药物的特性,需要进一步研究治疗炎症状况.
• 在各种体外试验中,T. cordifolia甲醇提取物表现出积极的效果,支持其传统的使用.