低点阿加罗斯作为 MALDI 质谱成像和激光捕捉微解剖基蛋白质组的嵌入介质

科学领域:

• 生物技术是生物技术.
• 蛋白质组学是指蛋白质组学.
• 质谱仪成像成像 质谱仪成像

背景情况:

• 多omics调查需要高质量的组织切片进行分子分析.
• 嵌入式介质有助于分割,但可以引入影响分析的污染物.
• 评估嵌入介质对于基于组织的研究中可靠的结果至关重要.

研究的目的:

• 评估低温嵌入介质在多omics工作流程中的组织切割的适用性.
• 为了比较嵌入媒体对MALDI质谱成像和蛋白质组学的影响.
• 为结合MALDI-MSI和LCM-蛋白质组学确定最佳嵌入介质.

主要方法:

• 七个低温嵌入介质被评估嵌入温度和切割性能.
• 最佳介质 (5%的凝,2%的糖) 与非嵌入式组织进行了比较.
• 分析包括脂质的MALDI质谱成像和激光捕获微解剖,然后是自下而上的蛋白质组学.

主要成果:

• 5%的凝和2%的低点阿加罗斯表现出切割的最佳机械性能.
• 两种嵌入介质都使低温嵌入和高质量的断面收集成为可能.
• 非嵌入式组织,2%的 agarose 和 5%的 gelatin 没有对蛋白质组学产生不良影响.
• 5%的凝在MALDI-MSI中引起轻微的离子抑制;2%的阿加罗斯与非嵌入式组织相比进行了比较.

结论:

• 2%低点糖是合适的嵌入介质,用于结合MALDI脂质质谱成像和激光捕获微解剖蛋白学的实验.
• 这种嵌入方法保持了组织完整性,并最大限度地减少了对下游分子分析的干扰.
• 这些发现支持使用2%的亚加进行强大的和可重复的多奥米克组织研究.