基因组序列草案和比较基因组分析揭示了乳酸酶ibacillus paracasei ItalPN16的潜在功能性质
Cristian Mauricio Barreto Pinilla1, Frank Guzman Escudero2, Adriana Torres Silva E Alves3
1Dairy Technology Center (TECNOLAT) of the Food Technology Institute (ITAL), Campinas, São Paulo, 13070-178, Brazil. cristianmaobarreto@gmail.com.
Current microbiology
|November 1, 2023
概括
从巴西奶酪中分离出来的Lacticaseibacillus paracasei ItalPN16菌株的生物信息分析揭示了重要的益生菌潜力. 它的基因组分析确定了微生物与宿主相互作用的关键基因,这表明了未来的食品工业应用.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 食品科学 食品科学 食品科学
背景情况:
- 对快速识别益生菌细菌越来越感兴趣.
- 需要鉴定传统食物来源的新型益生菌菌株的特征.
研究的目的:
- 使用生物信息工具研究Lacticaseibacillus paracasei ItalPN16菌株的益生菌潜力.
- 为了确定有助于其益生菌性质的特定遗传特征.
主要方法:
- 意大利PN16菌株的全基因组测序.
- 在基基因和平均核酸标识 (ANI) 分析.
- 对比基因组分析以确定菌株特定的基因和蛋白质表达水平.
主要成果:
- 意大利PN16菌株被归类为Lacticaseibacillus paracasei,与参考菌株的基因同质性>98%.
- 识别编码粘附蛋白和外聚糖生物合成的基因,对于微生物与宿主相互作用至关重要.
- 与益生菌L. paracasei BL29.29相比,发现了一种菌株特异性甘氨基转移酶和高预测蛋白质表达 (92%).
结论:
- 乳酸菌种Lacticaseibacillus paracasei ItalPN16菌株表现出有前途的益生菌特性.
- 鉴定的遗传特征支持其在食品行业的潜在应用.
