从照片中快速收集彩色数据的管道
Yvonne Luong1, Ariel Gasca-Herrera1, Tracy M Misiewicz2
1Biological Sciences San Jose State University San Jose, California 95192 USA.
Applications in plant sciences
|November 2, 2023
概括
北美壁花的花色在空间上有图案,但与气候没有很强的联系. 一个R闪亮的管道有效地分析公民科学图像进行景观规模的色彩研究.
科学领域:
- 生态生态学 生态生态学
- 植物学 植物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 对花颜色的景观规模研究有限,阻碍了对影响颜色变化的因素的理解.
- 诸如授粉者和非生物因素 (紫外线辐射,干旱) 等关键驱动因素需要在广泛的范围内进行进一步的研究.
研究的目的:
- 从公民科学数据开发和应用一个R闪亮的管道来分析花朵的颜色.
- 研究北美壁花 (Erysimum) 颜色的空间模式及其与气候的相关性.
- 为了比较原始图像与彩色校准图像的色彩分析.
主要方法:
- 开发了一个R闪亮的管道自动下载和样本花色从iNaturalist和全球生物多样性信息设施 (GBIF) 图像.
- 从 iNaturalist.收集了大约4800个北美壁花图像.
- 从原始图像与使用ColorCheckers进行校准的图像进行比较色彩分析.
主要成果:
- 鲜花的颜色表现出强烈的非随机空间分布,主要是由空间自相对应而不是气候驱动的.
- 观察到更细微的尺度模式,例如海拔和颜色之间的局部相关性.
- 使用原始和彩色校准图像的分析也产生了类似的结果.
结论:
- 开发的R闪亮管道可从像iNaturalist这样的公民科学平台快速捕获彩色数据.
- 这种工具对于使用大规模的,公开可用的图像数据集来检测花朵颜色的空间和时间变化是有价值的.
