在使用Illumina Infinium甲基化EPIC BeadChip的职业暴露矿工中进行DNA甲基组分析
Pinhua Zhang1, Yunyun Wu1, Chunnan Piao1
1Key Laboratory of Radiological Protection and Nuclear Emergency, China CDC, National Institute for Radiological Protection, Chinese Center for Disease Control and Prevention, 2 Xinkang Street, Deshengmenwai, Xicheng District, Beijing 100088, China.
Toxicology research
|November 2, 2023
概括
矿工的职业暴露会改变DNA甲基化模式,影响参与神经递质调节,免疫反应和细胞粘附的基因. 这些表观遗传变化提供了对子的洞察力.
科学领域:
- 环境表观遗传学环境表观遗传学
- 职业健康 职业健康 职业健康
- 分子毒理学分子毒理学
背景情况:
- 地下矿工的职业暴露与肺癌有关.
- 雷对肺部的有害影响背后的分子机制尚未完全理解.
- 表观遗传修饰,如DNA甲基化,可能会阐明在分子层面的影响.
研究的目的:
- 为了研究暴露于的地下矿工的全基因组DNA甲基化概况.
- 在应对职业暴露时识别差异甲基化位置 (DMP) 和相关基因.
- 探索可能受到诱导表观遗传变化的生物学途径.
主要方法:
- 使用Illumina Infinium人类甲基化850K珠芯片进行全基因组DNA甲基化分析.
- 地下矿工 (n=14) 和地表矿工 (n=9) 之间的甲基化概况比较.
- 使用热测序验证所选基因甲基化变化的验证.
主要成果:
- 与地面相比,地下工作场所的度显著更高.
- 在104个枢纽基因中确定了191个差异甲基化位置 (DMP) (gadgadgadΔβd ≥0.1,p <0.05).
- 丰富性分析表明参与神经递质调节,免疫调节效应和细胞粘附.
结论:
- 与地面工人相比,暴露于的地下矿工表现出不同的DNA甲基化模式.
- 暴露与基因组DNA甲基化异常有关.
- 需要进一步的研究来探索这些甲基化变化在神经免疫调节和细胞粘附中的作用.
