儿科白血病患者衍生异种移植模型的综合性表征
Anna Rogojina1, Laura J Klesse2,3,4, Erin Butler2,3,4
1Greehey Children's Cancer Research Institute, University of Texas Health San Antonio, San Antonio, TX, USA.
iScience
|November 2, 2023
概括
开发了儿童白血病的新型患者衍生异种移植 (PDX) 模型,包括来自西班牙裔患者的模型. 这些模型准确地反映了原发性瘤的遗传和分子特征,为研究提供了宝贵的资源.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 遗传学 遗传学 是一个
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 患者衍生异种移植 (PDX) 对白血病研究和治疗开发至关重要.
- 将PDX模型扩展到不同的群体,比如患有白血病的西班牙裔儿童,他们的结果较差,这是必不可少的.
研究的目的:
- 建立和描述儿童白血病的新型PDX模型,重点是西班牙裔患者的样本.
- 为了验证这些PDX模型在回顾原发性瘤的分子和免疫类型特征方面的忠实性.
主要方法:
- 收集了117个儿童原发性白血病样本,在82个 (70%) 个小鼠中成功移植了连续传递.
- 开发了一种新的算法来准确分析PDX模型中的多omics数据 (包括甲基化),以消除来自老鼠的污染.
- 进行了生殖系DNA测序,在初级瘤 (PT) 和PDX模型中明确识别体质突变.
主要成果:
- 来自西班牙裔和非西班牙裔患者样本的PDX模型实现了高移植率 (70%).
- 证明PDX模型忠实地复制体质突变,副本数量改变,RNA表达,基因融合,甲基化模式和原始瘤的免疫类型.
- 在PDX模型中通过生殖基因DNA测序证实了体性突变检测的准确性.
结论:
- 开发的PDX儿童白血病特征模型队列,包括来自西班牙裔患者的儿童白血病模型,是一个宝贵的资源.
- 这些PDX模型准确地代表了儿童白血病的生物复杂性,支持向治疗的开发.
- 分析受污染的多基因数据和识别体质突变的方法是稳健的,适用于未来的PDX研究.
