虚拟选,分子对接,分子动力学和MM-GBSA方法确定了中潜在的果糖-1,6-双酶抑制剂,用于糖尿病管理
Md Sanower Hossain1, Miah Roney2, Mohd Yusri Bin Mohd Yunus1,3
1Centre for Sustainability of Mineral and Resource Recovery Technology (Pusat SMaRRT), Universiti Malaysia Pahang Al-Sultan Abdullah, Kuantan, Malaysia.
Journal of biomolecular structure & dynamics
|November 2, 2023
概括
的废物产生一种潜在的抗糖尿病化合物,即丁-2,3-二二酸盐,可以抑制果糖-1,6-双酸酶 (FBPase). 这种天然化合物在糖尿病管理方面表现有前途,正在等待进一步的临床试验.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
- 药用化学 医学化学
背景情况:
- 糖尿病影响全球数百万人,需要新的治疗策略.
- 针对葡萄糖生成,特别是果糖-1,6-双酸酶 (FBPase),是糖尿病管理的一个有希望的途径.
- (Ananas comosus) 废物是天然化合物的可持续来源,具有潜在的药用益处.
研究的目的:
- 从废物中识别天然化合物,这些化合物可以抑制人类肝脏FBPase活性.
- 评估衍生物化合物的药物相似性和ADMET特性.
- 通过分子对接和模拟来评估潜在的FBPase抑制剂的结合亲和力和稳定性.
主要方法:
- 来自废物的112种化合物的虚拟选药物相似性和ADMET特性.
- 对20种选定化合物的分子对接模拟 (盲目对接) 与人类肝脏FBPase.
- 100 ns的分子动力学 (MD) 模拟化合物,-2,3-二乙酸盐及其与FBPase.复合物的模拟.
主要成果:
- 布-2,3-二乙酸盐被确定为一种化合物,其结合能为-5.4 kcal/mol,与甲福林 (-5.6 kcal/mol) 相比.
- MD模拟证实了稳定的FBPase-butane-2,3-diyl二酸盐复合物与关键的键,涉及特定的氨基酸.
- 化合物表现出高的肠溶性,表明快速吸收和有效的作用.
结论:
- 从废物中提取的丁-2,3-二二酸盐是一种潜在的抗糖尿病药物候选物.
- 该化合物的有利特性需要通过体外,临床前和临床研究进行进一步的研究.
- 这项研究突出了利用农业废物开发可持续和有效药剂的潜力.
