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Updated: Aug 3, 2026
07:28
A Small Volume Procedure for Viral Concentration from Water
Published on: February 3, 2015
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废水收集和度方法对病毒多样性的评估的影响
Yabing Li1, Brijen Miyani1, Kevin L Childs2
1Department of Civil and Environmental Engineering, Michigan State University, 1449 Engineering Research Ct, East Lansing, MI, United States.
The Science of the total environment
|November 2, 2023
概括
使用元基因组学的废水病毒监测是可行的. 病毒吸附-排泄 (VIRADEL) 方法产生了比聚乙烯糖醇 (PEG) 沉更多的病毒读数,改善了用于公共卫生监测的人类病毒检测.
科学领域:
- 环境病毒学环境病毒学
- 公共卫生监督是对公共卫生的监督.
- 转基因组学是指转基因组学.
背景情况:
- 污水监测对于监测社区疾病趋势和公共卫生准备工作至关重要.
- 高通量元基因组测序为废水监测提供了扩展的能力.
- 在废水中低度的人类病毒的样本处理和生物信息分析方面存在挑战.
研究的目的:
- 为了比较两种常见病毒度方法的有效性:病毒吸附-排泄 (VIRADEL) 和聚乙烯糖醇 (PEG) 沉.
- 评估它们对病毒识别和废水样本中人类病毒检测的影响.
- 评估元基因组学作为基于废水的流行病学选工具的可行性.
主要方法:
- 从三个拦截站点收集废水样本.
- 使用VIRADEL和PEG沉方法进行病毒度测试.
- 使用元基因组测序,然后对人类病毒数据库进行生物信息分析.
主要成果:
- 与PEG沉 (0.63%±0.19%) 相比,VIRADEL方法产生了显著更多的病毒读数 (2.84%±0.57%).
- 维拉德尔检测到更广泛的相对丰富的人类病毒,包括骨病毒,拉迪诺病毒和肝炎病毒.
- 贝塔冠状病毒,包括SARS-CoV-2,通过这两种方法检测到;然而,VIRADEL发现了更多不同的人类病毒.
结论:
- 废水的元基因组分析是公共卫生监测的可行一线查工具.
- 选择病毒度方法显著影响检测到的人类病毒的产量和多样性.
- 优化病毒度和生物信息方法对于有效的基于废水的病毒监测至关重要.
