长非编码RNA和mRNA表达特征在LPS诱导的心肌功能障碍的老鼠中

科学领域:

• 分子生物学分子生物学
• 心脏病学 心脏病学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 败血症是一种危险的全身炎症反应.
• 长非编码RNAs (lncRNAs) 有助于败血症的发展.
• lncRNAs在败血症引起的心脏功能障碍中的特定作用尚不清楚.

研究的目的:

• 研究因败血症引起的心肌功能障碍中 lncRNAs 的调节机制.
• 在与败血症有关的心脏问题背景下识别关键的lncRNA及其相互作用.

主要方法:

• 对lncRNA和mRNA表达特征进行微阵列分析.
• 生物信息分析包括基因本体学,KEGG通路分析和蛋白质-蛋白质相互作用网络.
• 同表达和竞争的内源RNA (ceRNA) 网络的构建.
• 使用脂多糖诱导性败血症大鼠模型和RT-qPCR的验证.

主要成果:

• 在败血性大鼠的左心室中鉴定出387个差异表达的lncRNA和1952个差异表达的mRNA.
• 凯格 (KEGG) 分析显示,在"补充和凝固级联"和"与免疫相关的生物过程"中,上调调节的基因得到了丰富.
• 创建了一个ceRNA网络,识别了8个与"离子结合"过程相关的lncRNA,这些过程可能与心肌功能障碍有关.

结论:

• lncRNAs和mRNAs之间的交叉声在败血症诱导的心肌功能障碍的发病过程中发挥着重要作用.
• 确定了特定的 lncRNAs,这些 lncRNAs可能作为新的生物标志物或治疗毒症相关心脏并发症的治疗标.