免疫相关基因模型预测结直肠癌的存活率,并反映了各种生物状态
Zhengchun Kang1, Bingchen Chen1, Xiuzhu Ma1
1Department of Colorectal Surgery, Changhai Hospital, Naval Medical University, Shanghai, China.
Frontiers in molecular biosciences
|November 3, 2023
概括
一个使用免疫相关基因的新模型预测了结直肠癌 (CRC) 患者的结果. 获得高分的患者显示出更好的生存率和更多的免疫细胞透,表明其作为临床指标的潜力.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 结肠直肠癌 (CRC) 的预后是复杂的,受基因环境相互作用的影响.
- 现有的预后模型往往侧重于特定的基因.
- 人们越来越认识到瘤免疫微环境在CRC进展中的作用.
研究的目的:
- 开发和验证基于免疫相关基因表达的结直肠癌预后模型.
- 研究该模型与临床特征,免疫透和药物反应的相关性.
主要方法:
- 基于免疫相关基因表达的模型的开发.
- 在七个独立数据集 (共1,325个样本) 中计算样本得分和验证.
- 与临床指标的相关性分析,PD-1/PD-L1表达,基因突变 (APC,MUC5B),免疫细胞透和药物敏感性 (IC50).
主要成果:
- 在所有经过验证的数据集中,高分数样本显示总体存活时间和无进展存活时间长得多.
- 模型得分与临床因素 (年龄,阶段) 和PD-1/PD-L1表达相关.
- 获得高分数的样本显示CD4+ T细胞,CD8+ T细胞,M1/M2巨细胞和NK细胞的透增加,以及激活的免疫相关途径.
- 在高和低分数组之间观察到药物敏感性 (较低的IC50) 的显著差异.
结论:
- 开发的与免疫相关的基因表达模型是结直肠癌患者结果的强有力的预测指标.
- 该模型反映了各种CRC状态和免疫微环境特征.
- 该模型显示了作为结直肠癌预后和治疗选择的有价值的临床指标的潜力.
