在北京,中国,Enterovirus 71的分子流行病学和植物动力学分析,2009-2019年
Jie Li1, Zhichao Liang2, Da Huo2
1Institute for HIV/AIDS and STD Prevention and Control, Beijing Center for Disease Prevention and Control, No.16, Hepingli middle Road, Dongcheng District, Beijing, 100013, People's Republic of China.
Virology journal
|November 4, 2023
概括
由肠道病毒71 (EV71) 引起的手足口病 (HFMD) 在北京显著下降. 有效的控制策略导致生殖率较低,表明疾病管理取得了成功.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 流行病学 流行病学
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 肠道病毒71 (EV71) 相关的手足口病 (HFMD) 在2009年至2019年期间在北京显著下降.
- 这种下降促使人们对该地区EV71的流行病学特征和进化动态进行了调查.
研究的目的:
- 从2009年到2019年在北京调查EV71的流行病学特征.
- 分析EV71菌株的进化动态,地理扩散和遗传特征.
- 通过估计有效生殖数量 (Re) 来评估控制策略的影响.
主要方法:
- 在北京 (2009-2019) 的EV71相关的HFMD病例的回顾性研究.
- 对EV71基因组的遗传学和遗传地理分析,以确定进化特征,起源和时空动态.
- 在VP1基因中识别积极选择位,并使用贝叶斯出生死亡地平线模型估计有效生殖数 (Re).
主要成果:
- 北京的EV71菌株表现出高度的同质性,每年每地点以4.99*10^-3的替代率进化.
- 遗传多样性在2012年达到顶峰,最近的共同祖先估计在2003年左右,起源于中国东部.
- 北京被确定为EV71向中国中部传播的关键来源,在VP1囊中积极选择的特定残留物 (E145Q/G,A293S).
结论:
- 近年来,EV71不再是北京HFMD的主要原因.
- 低估计的有效生殖数 (Re ≈ 1.007) 表明有效的HFMD预防和控制策略.
- 北京和东中国在传播EV71到中国其他地区方面发挥了重要作用.


