基于MAPK信号通路的质瘤亚型,机器学习风险模型和关键枢纽蛋白的识别
Hengrui Liu1,2, Tao Tang3,4
1Xinkaiyuan Pharmaceuticals, Beijing, China.
Scientific reports
|November 5, 2023
概括
甲基因激活蛋白激酶 (MAPK) 信号通路在质瘤中过度表达,影响患者的生存率. 这项研究确定了质瘤亚型和预后途径中的关键基因.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 早期的结质瘤诊断和精确的预后对于有效的治疗至关重要.
- 质瘤中激活蛋白激酶 (MAPK) 信号通路的临床意义需要进一步研究.
研究的目的:
- 探索质瘤中MAPK信号通路的临床价值.
- 为了识别MAPK通路基因用于质瘤亚型,预后和治疗向.
主要方法:
- 使用TCGA,GTEx和CGGA数据集进行基因表达分析.
- 根据MAPK路径基因应用共识聚类来分层质瘤亚型.
- 开发并验证了使用LASSO回归的预后风险模型.
主要成果:
- 对MAPK信号通路基因的过度表达在47%的质瘤病例中被观察到.
- 鉴定出了明显的质瘤亚型,在生存率,癌症干和免疫微环境方面存在显著差异.
- 一个经过验证的风险模型准确地预测了整体存活率,并与与癌症相关的特征相关联.
- 确定了12个关键的枢纽基因,其中8个与生存有显著的关联.
结论:
- 在质瘤中,MAPK信号通路经常过度表达,具有显著的预后价值.
- 基于MAPK通路基因的亚型化和风险分层化可以改善质瘤患者的治疗.
- 这项研究为为质瘤的MAPK途径开发向治疗提供了基础.
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