基因组挖掘符合Bacillus菌株的代谢物概况,以控制土豆病原体
Arezoo Lagzian1, Roohallah Saberi Riseh1, Sajjad Sarikhan2
1Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, Vali-e-Asr University of Rafsanjan, Rafsanjan, Iran.
Scientific reports
|November 5, 2023
概括
贝西勒斯·维莱泽尼斯菌株Q12和US1有效控制了土豆病原体Fusarium solani和Pectobacterium spp. 菌株Q12表现出对细菌病原体的优越控制,这是由于独特的基因集群产生抗菌化合物,如伊图林A.
科学领域:
- 农业科学 农业科学
- 微生物学 微生物学
- 植物病理学 植物病理学
背景情况:
- 生物控制剂为作物提供安全有效的疾病管理.
- 控制真菌 (Fusarium solani) 和细菌 (Pectobacterium spp.) 的两种情况. 马的病原体同时是具有挑战性的.
- 球细菌是新型生物控制剂的有希望的来源.
研究的目的:
- 识别和表征具有针对土豆病原体的广泛生物控制活性的细菌菌株.
- 研究有效的生物控制菌株的遗传基础和代谢特征.
- 评估在实验室和温室环境中选择的生物控制剂的疗效.
主要方法:
- 隔离和选500个细菌菌株从根球社区.
- 使用antiSMASH和RAST.使用有前途的菌株 (Bacillus velezensis Q12和US1) 的全基因组测序.
- 通过LC/MS/MS进行代谢分析,以确定抗微生物化合物生产.
主要成果:
- 百日菌 velezensis Q12和US1,以及伪菌 chlororaphis VUPf5 显示显著抑制真菌病原体.
- 菌株Q12在体内表现出对抗细菌病原体的优越控制 (约. 50%) 的比例.
- Q12具有洛基罗米辛和伊图林A的基因群,US1中缺少,与增强的抗菌活性相关.
结论:
- 贝西勒斯·维勒森西斯Q12是一种高度有效的生物控制剂,可以对抗真菌和细菌的土豆疾病.
- 在Q12中存在洛基罗米辛和伊图林A基因集群可能有助于其对细菌病原体的增强控制.
- 代谢分析证实了关键抗菌化合物的产生,验证了遗传发现并支持生物控制的有效性.
